제주버스정보시스템은 교통카드 하차 태그 후 40분 이내에 최대 2회 환승할인을 받을 수 있다고 안내한다. 간선·지선버스끼리 환승하는 경우와 급행·공항리무진으로 갈아타는 경우의 추가요금이 달라질 수 있다. 관광지순환버스도 일반 간·지선 요금 분류로 안내된다. 티머니·캐시비 등 전국 호환 선불 교통카드를 사용할 수 있으나 어린이·청소년 할인은 카드사에 연령 등록이 필요하다. 여러 사람을 한 장으로 결제하는 다인승 승차는 가능하더라도 다인승 환승할인은 제한된다. 하차 시 반드시 단말기에 태그하고 다음 버스의 노선 유형을 확인하자.