서대문자연사박물관 공식 버스 안내에 따르면 서대문 명소 순환 무료 셔틀은 월요일~금요일 09:00~18:00 운행하고 주말과 공휴일에는 운행하지 않는다. 홍제역, 독립문역, 서대문역, 연희동, 박물관 등을 연결한다. 1·2호차별 정류장 시간표가 서로 달라 출발 정류장과 회차를 직접 확인해야 한다. 도로 상황에 따라 시간표는 변경될 수 있다. 셔틀 문의는 02-360-8667이며, 운휴일에는 일반 버스 등을 이용해야 한다.