서대문자연사박물관 북파크는 3층의 자연사·과학 도서 열람 공간이다. 책은 외부 대출할 수 없으며 식음료 반입은 금지된다. 0~7세 영유아는 보호자와 함께 입장해야 한다. 공식 운영시간은 3~10월 평일 09:00~17:30, 주말·공휴일 09:00~18:30이고, 11~12월 평일 09:00~16:30, 주말·공휴일 09:00~17:30이다. 주말·공휴일은 회차별 이용시간을 따른다. 3~10월 마지막 7회차는 17:45~18:30, 11~12월 마지막 6회차는 16:45~17:30이다. 공식 안내에 1~2월 시간표가 없어 별도로 확인해야 한다.