제주항공 공식 운송 안내에서 반려동물은 생후 8주 이상인 개·고양이·새에 한하며, 반려동물과 케이지의 합계가 9kg 이하일 때 기내 반입할 수 있다. 국내선 반려동물 서비스 요금은 한 마리·한 구간당 25,000원이며, 이 항공사는 반려동물을 위탁수하물로 운송하지 않는다. 일반적인 단단한 운반용기는 가로·세로·높이 합 100cm 이하, 가로 37cm 이하, 높이 23cm 이하다. 유연한 소프트 케이지는 높이 28cm까지 가능하지만 앞좌석 아래에 안전하게 들어가야 한다. 성인 1인당 반려동물 1마리 기준이며 항공기당 기내 반입은 최대 6마리다. 홈페이지·모바일 또는 고객센터로 사전에 예약해야 한다. 동반 고객은 온라인 자동체크인과 모바일 탑승권 이용이 제한될 수 있어 공항 카운터 수속을 예상해야 한다. 국내선은 운송서약서, 국제선은 검역 및 예방접종 서류 등의 별도 요건을 확인하자.