에어부산의 기내 운송 대상은 개·고양이·애완용 새다. 성인 1인당 원칙적으로 1마리, 동물과 케이지 합계 9kg 이하여야 한다. 케이지는 가로 41cm·세로 21cm·높이 24cm 이내이면서 3면 합 115cm 미만이다. 국내선 반려동물 기내 동반요금은 편도 20,000원으로 일반 수하물요금과 별도다. 항공편별 탑승 가능 마릿수가 정해져 있어 사전에 예약센터 1666-3060에서 운송 확약을 받아야 한다. 국내선은 항공권 예매 또는 예약 후 부가서비스를 통해 신청할 수 있다. 비행 중 케이지에서 동물을 꺼낼 수 없고 출발일 공항에서 서약서 작성이 요구된다.